De acordo com a legislação brasileira, a organização sindical das atividades econômicas se estrutura em três planos: Confederação Nacional, Federação Estadual e Sindicatos Municipais. Os sindicatos, na base, representam diretamente as empresas individuais e coletivas em suas diversas categorias; as federações, com uma jurisdição mais ampla, em âmbito Estadual, resultam do agrupamento dos Sindicatos; e por último a Confederação é formada da reunião de todas as Federações.

Portanto, a Fecomércio é um órgão sindical e não estatal, formado pela união de diversos sindicatos, prestando-lhes assessoria nas áreas jurídica, econômica, sindical, administrativa, tecnológica e imprensa, além das pesquisas de mercado.

O Sistema Fecomércio nos estados é composto pelo SESC (Serviço Social do Comércio) e o Senac (Serviço Nacional de Aprendizagem Comercial). Ambas são entidades nacionais subordinadas Federações do Comércio e no âmbito federal à Confederação Nacional do Comércio. Sendo assim, o presidente do Conselho da Fecomércio é conseqüentemente também presidente dos conselhos do Sesc e Senac.